研究拠点メンバーを中心に,隔週で注目すべき論文の紹介・解説を行う.
- 発表概要を指定の様式に記入して,発表3日前までにe-mailで拠点事務室(島田)宛に送ってください.
場所:先端科学総合研究棟402-S(4)
開始時間:15:00
研究拠点メンバーを中心に,隔週で注目すべき論文の紹介・解説を行う.
場所:先端科学総合研究棟402-S(4)
開始時間:15:00
2016年
第29回 11月11日(金)
菅原 武志
Experimental/theoretical approach for chromosome conformation changes in response to an internal chemical cue
abstract
難波 利典
Stable Caenorhabditis elegans chromatin domains separate broadly expressed and developmentally regulated genes
abstract
第28回 11月5日(金)
中川 正基
Polymer physics of chromosome large-scale 3D organization
abstract
加治木 泰範
Engineered ascorbate peroxidase (APEX)-mediated proteomic mapping and fingerprinting
abstract
第27回 10月28日(金)
冨樫 祐一
Conformational Sampling Methods for Macromolecules and Recent Advances
abstract
新海 創也
Three-dimensional chromatin structure generated by the IMP combined with 5C data
abstract
第26回 6月17日(金)
加治木 泰範
Super-resolution imaging reveals distinct chromatin folding for different epigenetic states
abstract
第25回 6月10日(金)
難波 利典
Large scale chromosome folding is stable against local changes in chromatin structure
abstract
栃尾 尚哉
CTCF: making the right connections
abstract
第24回 6月3日(金)
菅原 武志
Droplet organization of membrane-less organelles:nucleolus sub-compartment formation driven by liquid phase separation
abstract
堀越 保則
Updated analytical approaches for multisubunit protein complexes
abstract
第23回 5月27日(金)
Holger Flechsig
Journal Club on ‘Nanoscale rotary apparatus from tight-fitting 3D DNA components’[3]
abstract
中川 正基
Delay chemical master equation: direct and closed-form solutions
abstract
第22回 5月6日(金)
冨樫 祐一
Protein-DNA Interactions and DNA Conformation: Simplified Modeling Studies
abstract
新海 創也
A simple biophysical model emulates budding yeast chromosome condensation
abstract
2015年
第21回 7月10日(金)
難波 利典
An Example of 3D Single-particle tracking in live Bacteria
abstract
第20回 7月3日(金)
加治木 泰範
Fluorescence Imaging of siRNA Delivery by PNA-based Probe
abstract
上脇 隼一
Time-resolved FRET imaging of protein-protein interactions in living cells
abstract
第19回 6月12日(金)
落合 博
Spatial genome organization: contrasting views from chromosome conformation capture and fluorescence in situ hybridization
abstract
第18回 6月5日(金)
菅原 武志
Mammalian Mitotic Chromosome Dynamics Through Mechanical Stress Cycles
abstract
第17回 5月29日(金)
栃尾 尚哉
Asymmetric Unwrapping of Nucleosomes under Tension Directed by DNA Local Flexibility
abstract
新海 創也
Quantitative analysis of chromatin compaction in living cells using FLIM-FRET
abstract
第16回 5月22日(金)
中川 正基
Noise-induced multistability in chemical systems: Discrete versus continuum modeling
abstract
冨樫 祐一
Nucleosome-Level Coarse-Grained Modeling and Simulations of Chromatin Structures
abstract
第15回 1月30日(金)
高見 知秀
Advances in injection and extraction to/from living cells with nanopipettes
abstract
上脇 隼一
In-Cell Fluorescence Activation and Labeling of Proteins Mediated by FRET-Quenched Split Inteins
abstract
加治木 泰範
Single-Layered Graphitic-C3N4 Quantum Dots for Two-Photon Fluorescence Imaging of Cellular Nucleus
abstract
第14回 1月23日(金)
栃尾 尚哉
Repeat 1 of TAL effectors affects target specificity for the base at position zero.
abstract
落合 博
3D imaging of Sox2 enhancer clusters in embryonic stem cells
abstract
堀越 保則
Nuclear organization, chromatin structure and DNA double-strand breaks repair
abstract
第13回 1月16日(金)
冨樫 祐一
Histone Modification – Cause or Consequence?
abstract
菅原 武志
The Bacterial Cytoplasm Has Glass-like Properties and Is Fluidized by Metabolic Activity
abstract
新海 創也
Microrheology measurements can diagnose the state of cell:Probing the stochastic, motor-driven properties of the cytoplasm using force spectrum microscopy
abstract
2014年
第12回 5月16日(金)
堀越 保則
Evaluating colocalization in super-resolution microscopy
abstract
加治木 泰範
Inhibition of histone binding by supramolecular hosts
abstract
第11回 5月2日(金)
落合 博
Linking stochastic fluctuations in chromatin structure and gene expression
abstract
菅原 武志
Bacterial chromosome organization and dynamics during cell cycle
abstract
第10回 4月25日(金)
栃尾 尚哉
Revisiting the TALE repeat
abstract
上脇 隼一
Enhanced chromatin dynamics by FACT promotes transcriptional restart after UV-induced DNA damage
abstract
第9回 4月18日(金)
冨樫 祐一
Steered molecular dynamics simulations of nucleosomos
abstract
新海 創也
Chromosome positioning of activity-based chromatin model
abstract
2013年
第8回 12月6日(金)
落合 博
Chromosomal contact permits transcription between coregulated genes
abstract
第7回 11月8日(金)
堀越 保則
Capturing binding location and speed of chromatin binding proteins
abstract
菅原 武志
Systematic characterization of the conformation and dynamics of budding yeast chromosome XII
abstract
第6回 11月1日(金)
栃尾 尚哉
Molecular dynamics simulations of DNA-free and DNA-bound TAL effectors
abstract
新海 創也
Fractal structure and kinetics of chromatin
abstract
第5回 7月19日(金)
李 聖林
Nuclear architecture of rod photoreceptor cells adapts to vision in mammalian evolution
abstract
第4回 7月5日(金)
落合 博
Chromatin interactions in trans are associated with stochastic selection for monoallelic gene activation
abstract
第3回 6月7日(金)
新海 創也
Introduction of the FCS analysis and its application to RCC1 binding to chromatin
abstract
第2回 5月24日(金)
栃尾 尚哉
Structural features of TALEs
abstract
第1回 5月10日(金)
菅原 武志
Genome-wide 3C mapping to reconstitute chromosome structure
abstract