原著論文

【学内連携のゲノム編集研究実績】（各メンバーの業績はそれぞれのHPを参照）
• Shukunami C, Takimoto A, Nishizaki Y, Yoshimoto Y, Tanaka S, Miura S, Watanabe H, Sakuma T, Yamamoto T, Kondoh G, Hiraki Y
  Scleraxis is a transcriptional activator that regulates the expression of Tenomodulin, a marker of mature tenocytes and ligamentocytes.
  Scientific Reports,  13(1):e0185987, 2018 (IF: 4.122)
  医歯薬保健学研究科と理学研究科によるゲノム編集による健細胞と靭帯細胞の転写因子機能解析に関する共同成果
• Sato'o Y, Hisatsune J, Yu L, Sakuma T, Yamamoto T and Sugai M
  Tailor-made gene silencing of Staphylococcus aureus clinical isolates by CRISPR interference.
  PLoS One,  13(1):e0185987, 2018 (IF: 2.766)
  医歯薬保健学研究科と理学研究科によるゲノム編集を用いた黄色ブドウ球菌の転写抑制に関する共同成果
• Miyamoto T, Natsuko Akutsu S, Fukumitsu A, Morino H, Masatsuna T, Hosoba K, Kawakami H, Yamamoto T, Shimizu K, Ohashi H and Matsuura S
  PLK1-mediated phosphorylation of WDR62/MCPH2 ensures proper mitotic spindle orientation.
  Human Molecular Genetics,  26(22):4429-4440, 2017 (IF: 5.340)
  原爆放射線医科学研究所と理学研究科によるゲノム編集法を用いた細胞分裂の方向性を調節する新たな分子経路の同定に関する共同成果
• Nakamura M, Kurungsee T, Sakuma T, Yamamoto T and Yanaka N
  TALEN-mediated targeted editing of the GDE5 gene suppresses fibroblastic cell proliferation.
  Biosci Biotechnol Biochem,  in press, 2017 (IF: 1.295)
  生物圏科学研究科と理学研究科によるTALENを用いた哺乳類繊維芽細胞におけるGDE5遺伝子の機能解析
• Royba E, Miyamoto T, Akutsu S, Hosoba K, Tauchi H, Kudo Y, Tashiro S, Yamamoto T and Matsuura S
  Evaluation of ATM heterozygous mutations underlying individual differences in radiosensitivity using genome editing in human cultured cells.
  Scientific Reports, 7: 5596, 2017 (IF: 4.259)
  原爆放射線医科学研究所と理学研究科によるゲノム編集法を用いた特定の遺伝子変化が放射線感受性に与える影響を高感度かつ定量的に評価する解析手法を確立に関する共同成果
• Sakuma T, Masaki K, Abe-Chayama H, Mochida K, Yamamoto T and Chayama K
  Highly multiplexed CRISPR-Cas9-nuclease and Cas9-nickase vectors for inactivation of hepatitis B virus.
  Genes to Cells,  21, 1253-1262, 2016 (IF: 2.481)
  医歯薬保健学研究院と理学研究科によるB型肝炎ウイルス（HBV）の安全かつ高効率な排除法に関する共同成果
• Guo L, Yamashita H, Kou I, Takimoto A, Meguro-Horike M, Sakuma T, Miura S, Adachi T, Yamamoto T, Ikegawa S, Hiraki Y and Shukunami C
  Investigation of a Non-coding Variant Associated with Adolescent Idiopathic Scoliosis in Zebrafish: Elevated Expression of the Ladybird Homeobox Gene Causes Body Axis Deformation.
  PLoS Genetics, 12: e1005802, 2016 (IF: 7.528)
  医歯薬保健学研究院と理学研究科による思春期特発性側弯症（AIS）の原因遺伝子LBX1の解析に関する共同成果
• Ochiai H, Sugawara T and Yamamoto T
  Simultaneous live imaging of the transcription and nuclear position of specific genes.
  Nucleic Acid Research, doi: 10.1093/nar/gkv624, 2015 (IF: 9.112)
  理学研究科の数理分子生命理学専攻とクロマチン動態数理研究拠点によるゲノム編集を用いたNanogの確率的遺伝子発現解析に関する論文
• Miyamoto T, Hosoba K, Ochiai H, Royba E, Izumi H, Sakuma T, Yamamoto T, Dynlacht BD and Matsuura S
  The microtubule depolymerizing activity of a mitotic kinesin protein KIF2A drives primary cilia disassembly coupled with cell proliferation.
  Cell Reports,  10: e0142946, 2015 (IF: 7.207)
  原爆放射線医科学研究所と理学研究科によるゲノム編集を用いた繊毛病の発症メカニズムの解明に関する共同成果
• Nakade S, Sakuma T, Sakane Y, Hara Y, Kurabayashi A, Kashiwagi K, Kashiwagi A, Yamamoto T and Obara M
  Homeolog-specific targeted mutagenesis in Xenopus laevis using TALENs.
  In Vitro Cellular & Developmental Biology - Animal, 51: 879-884, 2015 (IF: 1.000)
  理学研究科の生物科学専攻と数理分子生命理学専攻によるツメガエルでのゲノム編集に関する論文
  
• Nakade S, Tsubota T, Sakane Y, Kume S, Sakamoto N, Obara M, Daimon T, Sezutsu H, Yamamoto T, Sakuma T and Suzuki K
  Microhomology-mediated end-joining-dependent integration of donor DNA in cells and animals using TALENs and CRISPR/Cas9.
  Nature Communications, 5: 5560, 2015 (IF: 10.742)
  理学研究科の数理分子生命理学専攻と生物科学専攻によるゲノム編集による新規の遺伝子ノックイン技術開発に関する論文(日本経済新聞、中国新聞、共同通信より配信、日経バイオテクonline、Nature Japan注目の論文)
• Ochiai H, Sugawara T, Sakuma T and Yamamoto T
  Stochastic promoter activation affects Nanog expression variability in mouse embryonic stem cells.
  Scientific Reports, 4: 7125, 2014 (IF: 5.078)
  理学研究科の数理分子生命理学専攻とクロマチン動態数理研究拠点によるゲノム編集を用いたNanogの確率的遺伝子発現解析に関する論文
• Sakuma T, Nishikawa A, Kume S, Chayama K and Yamamoto T
  Multiplex genome engineering in human cells using all-in-one CRISPR/Cas9 vector system.
  Scientific Reports, 4: 5400, 2014 (IF: 5.078)
  理学研究科と医歯薬保健学研究科によるCRISPR／Casによる多重遺伝子破壊システム開発に関する論文(Nature Japan注目の論文)
• Tokumasu D, Sakuma T, Hayashi Y, Hosoi S, Hiyama E and Yamamoto T
  FAST-id system for enrichment of cells with TALEN-induced mutations and large deletions.
  Genes to Cells, 19: 419-431, 2014 (IF: 2.855)
  理学研究科と自然科学研究支援開発センターによるゲノム編集によって変異導入した細胞の濃縮システム開発に関する論文
• Ochiai H, Miyamoto T, Kanai A, Hosoba K, Sakuma T, Kudo Y, Asami K, Ogawa A, Watanabe A, Kajii T, Yamamoto T and Matsuura S
  TALEN-mediated single-base-pair editing identification of an intergenic mutation upstream of BUB1B as causative of PCS (MVA) syndrome.
  Proc Natl Acad Sci U S A, 111: 1461-1466, 2014 (IF: 9.809)
  原爆放射線医科学研究所と理学研究科によるゲノム編集（１塩基改変）を用いた疾患モデル細胞の作製に関する論文(PNAS Commentaryにピックアップ)
  
• Sakuma T, Ochiai H, Kaneko T, Mashimo T, Tokumasu D, Sakane Y, Suzuki K, Miyamoto T, Sakamoto N, Matsuura S and Yamamoto T
  Repeating pattern of non-RVD variations in DNA-binding modules enhances TALEN activity.
  Scientific Reports, 3: 3379, 2013 (IF: 5.078)
  理学研究科と原爆放射線医科学研究所による高活性型TALEN(Platinum TALEN)作製システム開発に関する論文(日刊工業新聞、日経バイオテクonline)
  
• Sakuma T, Hosoi S, Woltjen K, Suzuki KI, Kashiwagi K, Wada H, Ochiai H, Miyamoto T, Kawai N, Sasakura Y, Matsuura S, Okada Y, Kawahara A, Hayashi S and Yamamoto T
  Efficient TALEN construction and evaluation methods for human cell and animal applications.
  Genes to Cells, 18: 315-326, 2013 (IF: 2.855)
  理学研究科と原爆放射線医科学研究所によるTALEN作製システム開発と動物でのゲノム編集に関する論文
• Suzuki KI, Isoyama Y, Kashiwagi K, Sakuma T, Ochiai H, Sakamoto N, Furuno N, Kashiwagi A and Yamamoto T
  High efficiency TALENs enable F0 functional analysis by targeted gene disruption in Xenopus laevis embryos.
  Biology Open, 2: 448-452, 2013
  理学研究科の数理分子生命理学専攻と両生類研究施設によるアフリカツメガエルでのゲノム編集に関する論文